Спочатку Хакслі взагалі не сприймав еволюцію. Але Дарвін навернув його своєю працею «Про походження видів», і Хакслі згодом міркував: «Як надзвичайно дурно не подумати про це!»

Завдяки обміну зразками та технічним обговоренням анатомії ракушок, чоловіки стали друзями, причому Дарвін у листі від 20 лютого [1855] вперше звернувся до свого молодшого колеги «мій дорогий Хакслі».

Як свідчить прізвисько «бульдог Дарвіна», Хакслі був відвертим захисником і прихильником теорії Дарвіна про еволюцію шляхом природного відбору.

Соціальний дарвінізм/Т. Х. Хакслі: дисертація: егоїстичний і несолідарний конфлікт як основна константа формував людську єдність з первісних часів: «…і поза межами обмежених і тимчасових сімейних відносин, війна всіх проти всіх Гоббса була реальним станом існування» (1).

Томас Генрі Хакслі і Чарльз Дарвін виявив у 1857 році, що вони мають фундаментальні розбіжності щодо біологічної класифікації. Дарвін вважав, що природна система повинна виражати генеалогію, тоді як Хакслі наполягав на тому, що класифікація повинна базуватися на власній основі, незалежно від еволюції.

Зв’язок зі знімальним майданчиком Блумсбері Під час Першої світової війни Хакслі проводив багато часу в садибі Гарсінгтон поблизу Оксфорда, будинку леді Оттолайн Моррелл, працюючи батраком на фермі. Перебуваючи в Manor, він познайомився з кількома діячами Bloomsbury Group, в тому числі Бертран Рассел, Альфред Норт Вайтхед і Клайв Белл.