Гадин залишався в повній свідомості аж до моменту смерті, яка імовірно внаслідок серцевої недостатності. Лише через кілька днів після похорону могилу Гайдна розграбували, а його череп викрали.

Його поховали на місцевому цвинтарі, де його тіло непорушно пролежало в цілому 8 днів. Тоді, серед ночі, двоє чоловіків, які підкупили дяка, викопали вже трохи розтліле тіло (це був початок червня). Вони відрізав голову від тіла Гайдна і вивіз її.

У Відні помер знаменитий композитор Йозеф Гайдн. 77 років31 травня 1809 року після тривалої хвороби.

У 16 років Гайдну було вигнали зі св. Хор Стівена, бо його голос змінювався. Проте він продовжував розвиватися як музикант. Його попросили допомогти композитору Ніколі Порпорі, неаполітанському композитору, який писав для палацу родини Естергазі.

Нарешті в 1790 році Гайдн звільнився від своїх зобов'язань перед Естергазі і прийняв запрошення відвідати Англію. Там він мав величезний успіх у публіки. Незважаючи на його скромний початок і перші труднощі, Гайдн помер відомим композитором.

Він проводив свої дні все більш і більш бездіяльним і знерухомленим, страждаючи від порушення ходи. І все ж більшість біографів вважають дифузний атеросклероз і застійна серцева недостатність бути причиною стану здоров'я та фізичного занепаду Гайдна в останні роки його життя.