Що таке FTP-сайт для NCBI Blastdb?

admin | 4 Квітня, 2025


https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/5 січня 2024 р

Спосіб 1: за допомогою командного рядка (Windows) Введіть команду: у командному рядку введіть nslookup yourftpservername.com (замініть «yourftpservername.com» фактичною назвою вашого сервера) і натисніть Enter. Отримати IP-адресу: у командному рядку відображатиметься IP-адреса вашого FTP-сервера поруч із терміном «Адреса».

NCBI ftp завантаження геному

  1. Завантажте список усіх доступних еталонних геномів. завантажити повний список геномів, перевірених вручну (база даних RefSeq, яка є підмножиною GenBank) …
  2. Пошук доступних геномів виду. …
  3. Отримати посилання для завантаження FTP. …
  4. Запустити завантаження.

У правому меню виявлення в розділі «Аналіз цих послідовностей» натисніть «Запустити BLAST».. Це відкриє BLASTn, Nucleotide BLAST і автоматично додасть інвентарні номери цих еталонних послідовностей у поле Query Sequence.

Бази даних BLAST оновлюються щодня і можуть бути завантажені через FTP з https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/. Набори баз даних можна отримати автоматично за допомогою update_blastdb.pl, який є частиною набору BLAST+. Будь ласка, зверніться до документації бази даних BLAST для отримання додаткової інформації.

Давайте подивимося, як. У Windows це легко. Відкривши Провідник файлів, просто введіть адресу FTP-сайту в рядок адреси вгорі. Майте на увазі, що вам потрібно додати до сайту префікс FTP://, щоб Провідник знав, що йому потрібно підключитися до FTP-сервера, а не шукати розташування локально.