miRDB є онлайнова база даних для передбачення мішеней мікроРНК і функціональних анотацій. Усі мішені в miRDB були передбачені інструментом біоінформатики MirTarget, який був розроблений шляхом аналізу тисяч взаємодій мікроРНК-мішеней у результаті експериментів із високопродуктивним секвенуванням.

miRDB дозволяє користувачам надавати користувальницькі цільові послідовності мікроРНК або генів для прогнозування генів-мішеней або регуляторів мікроРНК на рівні транскриптому в одному з п’яти видів: людини, миші, щура, собаки або курки. Довжина налаштованої послідовності знаходиться в діапазоні 17–30 нуклеотидів для мікроРНК і 100–30 000 нуклеотидів для цільового гена.

МіРНК функціонує як керівництво шляхом спаровування основ з цільовою мРНК для негативного регулювання її експресії. Рівень комплементарності між направляючою та мРНК-мішенню визначає, який механізм глушіння буде використано; розщеплення цільової матричної РНК (мРНК) з подальшою деградацією або інгібуванням трансляції Рис.

від 50 до 100. Усі передбачені цілі мають оцінки передбачених цілей між 50-100. Ці оцінки призначає новий алгоритм прогнозування обчислювальної цілі. Чим вище оцінка, тим більше ми впевнені в цьому прогнозі. Ось чому результати пошуку впорядковуються за показником передбачення.');})();(function(){window.jsl.dh('7yzTZqjuDMOSwbkP6_XSoAM__42','

МікроРНК (міРНК) — це тип некодуючої РНК (РНК, яка не кодує білок) довжиною приблизно 22 основи.. Він зв’язується з комплементарною послідовністю в 3'UTR мРНК (кодуючої РНК) і таким чином регулює експресію гена. Кажуть, що 30-50% усіх генів регулюються таким чином.

Більшість цільових предикторів мікроРНК зосереджено на видах тварин і ефективність прогнозування суттєво падає, якщо застосовувати до видів рослин. Кілька заснованих на правилах предикторів мішеней мікроРНК були розроблені для видів рослин, але вони часто не можуть виявити нові мішені мікроРНК з неканонічним зв’язуванням мікроРНК-мРНК.