Застосуванням цього підходу є «правило 80%», згідно з яким ознаки, які мають відсутні точки даних у більш ніж 20% вибірок (тобто «частота спостереження» < 80%), видаляються з набору даних, після чого інші відсутні значення замінюються нулями.

Наразі золотим стандартом для анотації метаболіту є відповідність принаймні двох фізико-хімічних властивостей (наприклад, точного значення m/z, RT та MS/MS) виміряної функції з автентичними хімічними стандартами, виміряними за допомогою тієї самої платформи LC-MS, даних параметри збору та протоколи підготовки зразків (наприклад, …

Принципи FAIR – Можливість пошуку, доступність, сумісність і повторне використання – було запропоновано сприяти відкритій науці та управлінню даними багаторазового використання, а також максимізувати переваги, отримані від сучасних і офіційних наукових цифрових публікацій.

Коефіцієнт збагачення розраховується як кількість звернень у певному метаболічному шляху, поділена на очікувану кількість звернень.

Принцип: нецільова метаболоміка, навпаки, використовує цілісний та неупереджений підхід до профілювання метаболітів. Він спрямований на виявлення та ідентифікацію якомога більшої кількості метаболітів у зразку без попереднього знання їх ідентичності. Ця стратегія забезпечує комплексне уявлення про весь метаболом.

Алгоритм для фільтрації молекулярних формул виведений із семи евристичних правил: (1) обмеження на кількість елементів, (2) хімічні правила ЛЮЇСА та СТАРШОГО, (3) ізотопні моделі, (4) співвідношення водень/вуглець, (5) елемент співвідношення азоту, кисню, фосфору та сірки проти вуглецю, (6) співвідношення елементів …

ГХ-МС, РХ-МС та КЕ-МС усі вони працюють за допомогою різних механізмів для розділення метаболітів і забезпечення виявлення різних наборів метаболітів, хоча багато метаболітів можна виявити за допомогою кількох аналітичних методів.