Існує кілька типів взаємодії рослин і мікробів: конкуренція, комменсалізм, мутуалізм і паразитизм. Більш поширеними взаємодіями є комменсалізм або мутуалізм, коли або один, або обидва види отримують користь від відносин відповідно (Campbell, 1995).

Ризосфера – це широко поширена область з рослинними ексудатами, яка рекрутує мікроби, створюючи мікробний резервуар [8]. Мікроорганізми ризосфери постійно взаємодіють один з одним, у результаті чого комменсалізм, паразитизм, аменсалізм, сапрофітизм та симбіотичні асоціації.

Класи мікробних взаємодій

• Мутуалізм. …
• Протокооперація (Синергія) …
• Коменсалізм. …
• Хижацтво. …
• паразитизм. …
• Аменсалізм. …
• Конкуренція. …
• Взаємодія бактерій і грибів.

Мікроорганізми можуть бути вірулентними або авірулентними, або рослина може бути чутливою або стійкою до взаємодії рослинних мікробів. Отже, ця ситуація поділяє мікроорганізми на три кластери: патогенні або паразитичні, мутуалістичні та комменсалітичні мікроби.

Однак біотичні взаємодії рослин також включають алелопатія, мікориза, біологічна фіксація N₂, запилення комахами, передача сигналів та розпізнавання видів, а також паразити та патогени рослин. Негативні взаємодії рослин відбуваються найчастіше, але позитивні взаємодії були задокументовані.

Типи мікроорганізмів у ризосфері включають бактерії, гриби, актиноміцети та водорості. Мікробні популяції реагують на ексудати, що виділяються корінням рослин, їх кількість у ризосфері може відрізнятися в 10–100 разів від такої, що знаходиться в ґрунті.